Cambios genómicos adaptativos, resiliencia epigenética y nuevas herramientas moleculares para la conservación y recuperación de los endemismos ibéricos de la trucha común (CONSIBERTROMICS) Referencia: PID2022-141549OB-I00
Objetivos
El objetivo principal de Consibertromics es determinar el valor adaptativo histórico de la divergencia genómica entre las poblaciones de trucha y el papel de la expresión génica y los patrones epigenéticos en la resiliencia a los cambios ambientales.
Este objetivo se pretende cumplir mediante:
- La evaluación a nivel genómico los factores evolutivos subyacentes a la distribución histórica de los linajes nativos dentro y entre cuencas fluviales ibéricas,
- La identificación los factores locales, regionales y climáticos principales que conforman el genoma de esos linajes dentro y entre ríos,
- La determinación de paralelismos entre la variación adaptativa en respuesta a la hibridación pasada y actual a partir de contactos secundarios entre linajes, y
- La evaluanción diferencias en expresión génica y metilomas entre los linajes ibéricos y los stocks no-nativos criados en condiciones silvestres y en centros piscícolas.
Los objetivos científicos específicos del proyecto son:
- Determinar la divergencia y variabilidad genómica a nivel macro y microestructural tipificando los linajes ibéricos autóctonos (AT, DU, ME y AD) y las poblaciones no autóctonas de piscifactoría de origen AT.
- Identificación de las regiones genómicas de la trucha común y los genes candidatos bajo selección dentro y entre linajes de trucha común ibérica y cuencas hidrográficas.
- Identificación de paralelismos en los gradientes latitudinales de variación en SNPs entre los ríos de las cuencas atlántica y mediterránea.
- Identificación de paralelismos genómicos resultantes de contactos secundarios entre linajes de trucha en la Península Ibérica
- Evaluar la expresión génica y las divergencias epigenéticas (metiloma) entre linajes ibéricos autóctonos y poblaciones no autóctonas de piscifactoría criados en condiciones de cultivo controladas.
- Desarrollo de una herramienta molecular basada en SNPs evolutivos (= linaje), hidrográficos y de expresión génica atípicos (i.e. outliers) que permitan la trazabilidad de especímenes de trucha silvestre para mejorar los programas de conservación y recuperación de las poblaciones autóctonas de trucha común ibérica.